Однонуклеотидные полиморфизмы (ОНП, SNPs, англ.) - это однонуклеотидные позиции в геномной ДНК, для которых в некоторой популяции имеются различные варианты последовательностей (аллели), причём редкий аллель встречается с частотой не менее 1%.
Надежный метод геномного скрининга ОНП позволил бы разработать стандартный подход к исследованию молекулярной природы предрасположенности к различным заболеваниям и предсказанию индивидуальной чувствительности к лекарственным средствам.
На обучающем портале «Практическая молекулярная биология» www.molbiol.edu Вы можете познакомиться с электронной книгой Татьяны Бородиной (Институт биологии гена) «Методы детекции SNP».
ВВЕДЕНИЕ
ИЗВЕСТНЫЕ МЕТОДЫ ДЕТЕКЦИИ SNP
- Ферментативные методы
- Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов и полиморфизм длин амплифицированных фрагментов
- Расщепление ДНК структуро-специфическими эндонуклеазами
- Инвазивное расщепление олигонуклеотидного зонда
- Лигазная детекция
- Прямая терминация ПЦР
- Аллель-специфическая ПЦР
- Химические методы
- Дискриминация аллельных вариантов электрофорезом
- Полиморфизм конформации одноцепочечной ДНК
- Анализ гетеродуплексов
- Модифицированный сиквенс
- Дискриминация аллельных вариантов на твёрдой фазе
- Олигонуклеотидные микроматрицы для гибридизационного анализа
- Минисеквенирование
- Оптиковолоконный ДНК гибридизационный анализ
- Хроматографические методы дискриминации аллельных вариантов
- Физические методы детекции SNP
- Масс-спектрометрическое секвенирование
- Резонансный перенос энергии флуоресценции
- Люминесценция, зависящая от локального окружения
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Источник:
-
Практическая молекулярная биология